Nasceu em La Rioja, Espanha, perto do ano 1000. Entrou de religioso com os Padres Beneditinos no famoso monastério de são Millán de la Cogolla, e estando ali, fez grandes progressos espirituais recebendo do Espírito Santo a inspiração para interpretar os temas da Revelação divina contidos na Sagrada Bíblia.
Chegou a ser superior do convento, e em só dois anos restaurou totalmente aquela construção que já estava deteriorada.
Um dia chegou o rei de Navarro a lhe exigir que lhe entregasse os cálices sagrados e o mais valioso que houvesse no convento para dedicar tudo isto aos gastos de guerra. São Domingo lhe enfrentou corajosamente e lhe disse: "Pode matar o corpo e à carne fazer sofrer mas sobre a alma não tem nenhum poder. O evangelho me há isso dito, e a ele devo acreditar que só ao que ao inferno pode jogar o ama, a esse devo temer".
O rei de Navarro, cheio de indignação desterrou ao abade Domingo. Ao inteirar-se do ocorrido, o rei Fernando I de Castela, mandou-o chamar e lhe confiou o Monastério de Silos, que estava em um lugar estéril e afastado; além disso se achava em estado de total abandono e descuido, tanto no material como no espiritual.
Santo Domingo demonstrou ser um gênio organizador com um talento para a restauração. Levantou um monastério ideal, e formou, entre outras coisas, uma biblioteca cheia dos melhores livros desse tempo, transformando aquela casa em um lugar de trabalho e oração.
Santo Domingo de Silos conseguiu liberar a mais de 300 cristãos que estavam prisioneiros e eram utilizados como escravos pelos muçulmanos. Por esta razão lhe representa freqüentemente acompanhado de homens com cadeias.
O biógrafo, que escreveu sobre a vida deste santo, pouco depois de sua morte, diz que não havia enfermidade que as orações deste santo não conseguissem curar.
E após 96 anos de sua morte, o santo apareceu em sonhos à mamãe de Santo Domingo de Guzmán para lhe anunciar que teria um filho que seria um grande apóstolo. Por isso quando o menino nasceu o chamaram Domingo em honra ao santo de Silos. É por isso também que muitas mães na Espanha se encomendam ao Santo Domingo de Silos para obter que seu filho nasça bem e que quando crescer leve uma vida Santa.
Morreu em 20 de dezembro do ano 1073, e ainda se conserva o famoso monastério de Santo Domingo.