Nasceu em 9 de abril de 1848 em Alfaro, Rioja Espanha. No seio de uma humilde família e com grande devoção católica, seus pais foram Félix Moreno e Josefa Díaz. Desde garoto descobriu sua vocação à vida religiosa e em 21 de setembro de 1884 ingressou como religioso no convento espanhol dos agostinianos recoletos no Montegudo, Navarra. Ao ano seguinte fez sua profissão religiosa no teologado da Marcilla. Em 1870 viajou ao Manila, Filipinas, onde se desempenhou como missionário. No ano seguinte foi ordenado sacerdote e destinado ao Mindoro onde continuou suas atividades missionárias. Pouco tempo depois se adoeceu de paludismo e retornou a Manila.
Mais tarde foi nomeado superior do convento do Monteagudo e volta para a Espanha para dedicar-se à formação dos futuros religiosos missionários.
Em 1888 viajou a Colômbia ao mando de um grupo de missionários agostinianos recoletos empreende. Neste país começou a reativar as missões e em 1893 foi nomeado bispo titular de Pinar e vigário apostólico de Casanare, em 1895 foi nomeado Bispo de Pasto. Santo Ezequiel desempenhou sua nova missão com a eficácia e generosidade que o caracterizavam mas teve que superar numerosos obstáculos.
Em 1905 foi-lhe diagnosticado câncer e diante das reiteradas súplicas dos fiéis e dos religiosos de sua Ordem, ao ano seguinte voltou para a Espanha para operar-se. A operação não teve êxito e Santo Ezequiel, firme em sua fé, retirou-se ao convento do Monteagudo, Espanha, onde morreu em 19 de agosto de 1906.
Sua fama de santidade cresceu rapidamente, sobretudo na Colômbia. Foi beatificado pelo Papa Paulo VI em 1975 e em 11 de outubro de 1992 foi canonizado pelo Papa João Paulo II . Santo Ezequiel Moreno é considerado como o especial intercessor diante de Deus pelos doentes do câncer e um dos maiores apóstolos da Evangelização da América.
